Ніколаєнко, Т. Ю.
    Квантово-механічний конформаційний аналіз молекули 5′-тимідилової кислоти [Текст] / Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун // Укр. біохім. журн : Науково-теоретичний журнал. - 2010. - Т. 82, N 6. - С. 76-86 . - ISSN 0201-8470
Анотація: Методами обчислювальної квантової механіки на рівні теорії MP2/6-311++G(d,p) // B3LYP/6-31G(d,p) проведено повний конформаційний аналіз структурної ланки ДНК – нуклеотиду з тиміновою основою та електронейтральною фосфатною групою у 5′-положенні. Виявлено 660 його конформацій із відносними енергіями Гіббса 0÷11,1 ккал/моль за нормальних умов. Серед них шість конформерів подібні до структури нуклеотиду ДНК у AI-, один – у AII- і сім – в BI-формах відповідно. Найнижчу енергію Гіббса серед ДНК-подібних конформерів (∆G = 2,7 ккал/моль) має BI-ДНК-подібна структура. Показано, що глікозидний зв’язок є найлабільнішим з усіх хімічних зв’язків молекули. Продемонстровано роль внутрішньомолекулярних водневих зв’язків типу CH∙∙∙O у формуванні просторової структури конформерів 5′-тимідилової кислоти.


Дод.точки доступу:
Булавін, Л. А.; Говорун, Д. М.
Примірників всього: 1
ЧЗ (1)
Свободны: ЧЗ (1)